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中國科學院沈陽應用生態研究所成立于1954年，是以林業、農業、環境科學為基礎的綜合性應用生態學研究機構。現有森林生態與林業生態工程、土壤生態與農業生態工程、污染生態與環境生態工程3個研究中心、森林生態與保育重點實驗室（中國科學院）、1個國地聯合實驗室、3個院級實驗室、11個省級實驗室和專業技術創新中心。研究所在不同地帶、不同類型地區建有12個野外站，包括4個國家站(同為院CERN站)、1個院級站、3個所級站和4個與國家林草局共建站。研究所還擁有東北地區最大的生物標本館以及被譽為“大城市中小森林”之稱的沈陽樹木園。研究所面向國家生態文明建設的重大戰略需求——以碳中和、黑土地保護、國家生態安全等為研究目標，針對現代農林業可持續發展和生態環境建設中亟需解決的重大科技問題，瞄準國際應用生態學發展前沿，在森林生態與林業生態工程、土壤生態與農業生態工程、污染生態與環境生態工程領域開展基礎性、戰略性和前瞻性研究。完善和創新應用生態學理論、方法和技術體系；聚焦退化生態系統恢復-重建與生態安全、黑土地保護-利用與糧食安全、污染環境治理-改善與低碳綠色發展；為東北工農業現代化和新型城鎮化提供生態與環境保障，為生態文明-美麗中國建設提供科技支撐。